Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms