Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms