Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG7P83436 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG7P83436 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG7P83436 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG7P83436 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
COG7P83436 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG7P83436 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG7P83436 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
COG7P83436 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
COG7P83436 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG7P83436 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG7P83436 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG7P83436 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG7P83436 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG7P83436 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG7P83436 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG7P83436 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG7P83436 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG7P83436 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG7P83436 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG7P83436 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG7P83436 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG7P83436 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG7P83436 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG7P83436 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG7P83436 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG7P83436 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG7P83436 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG7P83436 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG7P83436 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG7P83436 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG7P83436 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG7P83436 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG7P83436 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG7P83436 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG7P83436 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG7P83436 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG7P83436 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG7P83436 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG7P83436 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG7P83436 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG7P83436 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG7P83436 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG7P83436 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
COG7P83436 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG7P83436 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG7P83436 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG7P83436 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG7P83436 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG7P83436 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG7P83436 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG7P83436 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG7P83436 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG7P83436 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG7P83436 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG7P83436 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG7P83436 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
COG7P83436 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
COG7P83436 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG7P83436 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG7P83436 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG7P83436 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG7P83436 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG7P83436 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG7P83436 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG7P83436 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG7P83436 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG7P83436 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG7P83436 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG7P83436 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG7P83436 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG7P83436 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG7P83436 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG7P83436 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG7P83436 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG7P83436 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG7P83436 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG7P83436 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG7P83436 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG7P83436 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG7P83436 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG7P83436 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG7P83436 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG7P83436 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG7P83436 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG7P83436 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG7P83436 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG7P83436 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG7P83436 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG7P83436 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG7P83436 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COG7P83436 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COG7P83436 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COG7P83436 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG7P83436 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG7P83436 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG7P83436 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG7P83436 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG7P83436 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COG7P83436 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms