Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP1P63208 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP1P63208 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP1P63208 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP1P63208 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP1P63208 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP1P63208 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP1P63208 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP1P63208 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP1P63208 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP1P63208 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP1P63208 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP1P63208 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP1P63208 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP1P63208 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP1P63208 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP1P63208 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP1P63208 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP1P63208 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP1P63208 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP1P63208 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP1P63208 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP1P63208 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP1P63208 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP1P63208 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP1P63208 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP1P63208 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP1P63208 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP1P63208 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP1P63208 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP1P63208 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP1P63208 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP1P63208 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP1P63208 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP1P63208 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP1P63208 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP1P63208 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP1P63208 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP1P63208 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP1P63208 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP1P63208 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP1P63208 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP1P63208 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP1P63208 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP1P63208 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP1P63208 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP1P63208 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP1P63208 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP1P63208 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP1P63208 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP1P63208 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP1P63208 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP1P63208 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP1P63208 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP1P63208 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP1P63208 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP1P63208 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP1P63208 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP1P63208 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP1P63208 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP1P63208 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP1P63208 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP1P63208 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP1P63208 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP1P63208 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP1P63208 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP1P63208 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP1P63208 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP1P63208 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP1P63208 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP1P63208 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP1P63208 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP1P63208 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP1P63208 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP1P63208 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms