Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms