Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV4P43268 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV4P43268 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV4P43268 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV4P43268 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV4P43268 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV4P43268 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV4P43268 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV4P43268 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV4P43268 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV4P43268 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV4P43268 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV4P43268 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV4P43268 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV4P43268 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV4P43268 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV4P43268 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV4P43268 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV4P43268 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV4P43268 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV4P43268 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV4P43268 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV4P43268 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV4P43268 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV4P43268 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV4P43268 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV4P43268 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV4P43268 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV4P43268 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV4P43268 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV4P43268 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV4P43268 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV4P43268 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV4P43268 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV4P43268 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV4P43268 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV4P43268 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV4P43268 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV4P43268 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV4P43268 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV4P43268 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV4P43268 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV4P43268 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV4P43268 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV4P43268 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV4P43268 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV4P43268 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV4P43268 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV4P43268 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV4P43268 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV4P43268 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV4P43268 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV4P43268 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV4P43268 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV4P43268 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV4P43268 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV4P43268 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV4P43268 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV4P43268 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV4P43268 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV4P43268 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV4P43268 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV4P43268 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV4P43268 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV4P43268 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV4P43268 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV4P43268 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV4P43268 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV4P43268 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV4P43268 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV4P43268 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV4P43268 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV4P43268 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV4P43268 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV4P43268 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV4P43268 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV4P43268 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV4P43268 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV4P43268 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV4P43268 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV4P43268 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV4P43268 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV4P43268 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV4P43268 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV4P43268 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV4P43268 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV4P43268 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV4P43268 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV4P43268 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV4P43268 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV4P43268 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV4P43268 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV4P43268 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV4P43268 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV4P43268 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV4P43268 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV4P43268 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV4P43268 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV4P43268 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV4P43268 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms