Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM5CP41229 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM5CP41229 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM5CP41229 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM5CP41229 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM5CP41229 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM5CP41229 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM5CP41229 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM5CP41229 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM5CP41229 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM5CP41229 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM5CP41229 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM5CP41229 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM5CP41229 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM5CP41229 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM5CP41229 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM5CP41229 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM5CP41229 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM5CP41229 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM5CP41229 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM5CP41229 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5CP41229 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5CP41229 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5CP41229 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5CP41229 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5CP41229 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5CP41229 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5CP41229 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5CP41229 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5CP41229 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5CP41229 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5CP41229 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5CP41229 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5CP41229 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5CP41229 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5CP41229 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5CP41229 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5CP41229 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5CP41229 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM5CP41229 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM5CP41229 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM5CP41229 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM5CP41229 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM5CP41229 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM5CP41229 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM5CP41229 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM5CP41229 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms