Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms