Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms