Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms