Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms