Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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NFKB1P19838 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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NFKB1P19838 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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NFKB1P19838 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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NFKB1P19838 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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NFKB1P19838 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKB1P19838 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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