Protein–RNA interactions for Protein: P17252

PRKCA, Protein kinase C alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCAP17252 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms