Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms