Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms