Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms