Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIMD1P0DJR0 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms