Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F6O75461 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F6O75461 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F6O75461 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F6O75461 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F6O75461 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F6O75461 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F6O75461 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F6O75461 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F6O75461 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F6O75461 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F6O75461 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F6O75461 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F6O75461 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F6O75461 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F6O75461 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F6O75461 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F6O75461 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F6O75461 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F6O75461 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F6O75461 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F6O75461 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F6O75461 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F6O75461 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F6O75461 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F6O75461 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F6O75461 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F6O75461 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F6O75461 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F6O75461 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F6O75461 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F6O75461 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F6O75461 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F6O75461 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F6O75461 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F6O75461 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F6O75461 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F6O75461 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F6O75461 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F6O75461 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F6O75461 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F6O75461 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F6O75461 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F6O75461 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F6O75461 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F6O75461 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F6O75461 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F6O75461 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F6O75461 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F6O75461 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms