Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSVO60911 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSVO60911 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSVO60911 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSVO60911 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSVO60911 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSVO60911 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSVO60911 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSVO60911 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSVO60911 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSVO60911 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSVO60911 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSVO60911 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSVO60911 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSVO60911 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSVO60911 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSVO60911 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSVO60911 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSVO60911 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSVO60911 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSVO60911 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSVO60911 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSVO60911 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSVO60911 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSVO60911 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSVO60911 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSVO60911 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSVO60911 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSVO60911 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSVO60911 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSVO60911 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSVO60911 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSVO60911 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSVO60911 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSVO60911 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSVO60911 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSVO60911 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSVO60911 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSVO60911 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSVO60911 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSVO60911 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSVO60911 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSVO60911 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSVO60911 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSVO60911 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSVO60911 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSVO60911 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSVO60911 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSVO60911 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSVO60911 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSVO60911 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSVO60911 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSVO60911 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSVO60911 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSVO60911 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSVO60911 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSVO60911 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSVO60911 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSVO60911 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSVO60911 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSVO60911 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSVO60911 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSVO60911 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSVO60911 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSVO60911 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSVO60911 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSVO60911 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSVO60911 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSVO60911 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSVO60911 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSVO60911 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSVO60911 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSVO60911 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSVO60911 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSVO60911 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSVO60911 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSVO60911 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSVO60911 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSVO60911 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSVO60911 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSVO60911 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSVO60911 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSVO60911 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSVO60911 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSVO60911 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSVO60911 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSVO60911 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSVO60911 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSVO60911 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSVO60911 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSVO60911 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSVO60911 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSVO60911 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSVO60911 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSVO60911 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSVO60911 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSVO60911 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSVO60911 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSVO60911 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSVO60911 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms