Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms