Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLX3O43711 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLX3O43711 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLX3O43711 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLX3O43711 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLX3O43711 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLX3O43711 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLX3O43711 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLX3O43711 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLX3O43711 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLX3O43711 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLX3O43711 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLX3O43711 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLX3O43711 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLX3O43711 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLX3O43711 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLX3O43711 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLX3O43711 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLX3O43711 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLX3O43711 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLX3O43711 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLX3O43711 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLX3O43711 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLX3O43711 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLX3O43711 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLX3O43711 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLX3O43711 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TLX3O43711 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLX3O43711 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLX3O43711 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLX3O43711 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLX3O43711 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLX3O43711 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLX3O43711 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLX3O43711 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLX3O43711 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLX3O43711 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLX3O43711 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLX3O43711 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLX3O43711 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLX3O43711 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLX3O43711 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLX3O43711 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLX3O43711 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLX3O43711 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLX3O43711 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLX3O43711 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLX3O43711 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLX3O43711 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLX3O43711 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLX3O43711 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLX3O43711 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLX3O43711 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLX3O43711 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TLX3O43711 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLX3O43711 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLX3O43711 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLX3O43711 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLX3O43711 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLX3O43711 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLX3O43711 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLX3O43711 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLX3O43711 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TLX3O43711 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLX3O43711 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TLX3O43711 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLX3O43711 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TLX3O43711 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLX3O43711 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLX3O43711 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLX3O43711 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLX3O43711 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLX3O43711 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLX3O43711 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLX3O43711 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLX3O43711 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLX3O43711 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLX3O43711 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLX3O43711 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLX3O43711 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLX3O43711 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLX3O43711 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLX3O43711 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLX3O43711 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLX3O43711 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLX3O43711 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLX3O43711 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLX3O43711 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLX3O43711 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLX3O43711 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLX3O43711 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLX3O43711 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLX3O43711 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLX3O43711 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLX3O43711 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLX3O43711 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TLX3O43711 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLX3O43711 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLX3O43711 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLX3O43711 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms