Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DENRO43583 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DENRO43583 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DENRO43583 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DENRO43583 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DENRO43583 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DENRO43583 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DENRO43583 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DENRO43583 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DENRO43583 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DENRO43583 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DENRO43583 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DENRO43583 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DENRO43583 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DENRO43583 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DENRO43583 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DENRO43583 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DENRO43583 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DENRO43583 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DENRO43583 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DENRO43583 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DENRO43583 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DENRO43583 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DENRO43583 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DENRO43583 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DENRO43583 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DENRO43583 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DENRO43583 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DENRO43583 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DENRO43583 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DENRO43583 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DENRO43583 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DENRO43583 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DENRO43583 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DENRO43583 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DENRO43583 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DENRO43583 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DENRO43583 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DENRO43583 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DENRO43583 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DENRO43583 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DENRO43583 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DENRO43583 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DENRO43583 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DENRO43583 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DENRO43583 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DENRO43583 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DENRO43583 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DENRO43583 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DENRO43583 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DENRO43583 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DENRO43583 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DENRO43583 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DENRO43583 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DENRO43583 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DENRO43583 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DENRO43583 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DENRO43583 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DENRO43583 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DENRO43583 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DENRO43583 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DENRO43583 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DENRO43583 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DENRO43583 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DENRO43583 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DENRO43583 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DENRO43583 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DENRO43583 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DENRO43583 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DENRO43583 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DENRO43583 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DENRO43583 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DENRO43583 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DENRO43583 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DENRO43583 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DENRO43583 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DENRO43583 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DENRO43583 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DENRO43583 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DENRO43583 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DENRO43583 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DENRO43583 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DENRO43583 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DENRO43583 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DENRO43583 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DENRO43583 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DENRO43583 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DENRO43583 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DENRO43583 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DENRO43583 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DENRO43583 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DENRO43583 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DENRO43583 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DENRO43583 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DENRO43583 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DENRO43583 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DENRO43583 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DENRO43583 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DENRO43583 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DENRO43583 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms