Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms