Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms