Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms