Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms