Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
L1RE1Q9UN81 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms