Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms