Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms