Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms