Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB6

PARD6A, Partitioning defective 6 homolog alpha, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6AQ9NPB6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms