Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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