Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms