Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPR88Q9GZN0 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GPR88Q9GZN0 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPR88Q9GZN0 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPR88Q9GZN0 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPR88Q9GZN0 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPR88Q9GZN0 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPR88Q9GZN0 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPR88Q9GZN0 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPR88Q9GZN0 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GPR88Q9GZN0 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GPR88Q9GZN0 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GPR88Q9GZN0 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GPR88Q9GZN0 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms