Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms