Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM106CQ9BVX2 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM106CQ9BVX2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM106CQ9BVX2 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM106CQ9BVX2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM106CQ9BVX2 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 SMIM11A-201ENST00000399292 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 TTTY14-204ENST00000452584 860 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 AC004672.2-201ENST00000537181 574 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 AC130324.1-201ENST00000584157 831 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms