Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms