Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms