Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms