Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELP4Q96EB1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms