Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms