Protein–RNA interactions for Protein: Q92618

ZNF516, Zinc finger protein 516, humanhuman

Predictions only

Length 1,163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF516Q92618 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF516Q92618 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms