Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms