Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms