Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms