Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms