Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SYT9Q86SS6 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SYT9Q86SS6 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SYT9Q86SS6 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SYT9Q86SS6 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SYT9Q86SS6 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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