Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms