Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms