Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms